Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ifitm3Q9CQW9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ifitm3Q9CQW9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ifitm3Q9CQW9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ifitm3Q9CQW9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ifitm3Q9CQW9 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ifitm3Q9CQW9 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ifitm3Q9CQW9 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ifitm3Q9CQW9 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms