Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ykt6Q9CQW1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ykt6Q9CQW1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ykt6Q9CQW1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ykt6Q9CQW1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ykt6Q9CQW1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ykt6Q9CQW1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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