Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PsenenQ9CQR7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms