Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms