Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim26Q99PN3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms