Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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