Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms