Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms