Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms