Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms