Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
EpcamQ99JW5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
EpcamQ99JW5 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
EpcamQ99JW5 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
EpcamQ99JW5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
EpcamQ99JW5 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
EpcamQ99JW5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
EpcamQ99JW5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms