Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms