Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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