Protein–RNA interactions for Protein: Q91V98

Cd248, Endosialin, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cd248Q91V98 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd248Q91V98 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd248Q91V98 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd248Q91V98 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd248Q91V98 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd248Q91V98 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd248Q91V98 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd248Q91V98 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd248Q91V98 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd248Q91V98 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cd248Q91V98 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cd248Q91V98 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cd248Q91V98 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cd248Q91V98 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cd248Q91V98 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cd248Q91V98 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cd248Q91V98 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd248Q91V98 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cd248Q91V98 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cd248Q91V98 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cd248Q91V98 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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