Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top1mtQ8R4U6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms