Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms