Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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