Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbm48Q8K2X2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms