Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Abcf3Q8K268 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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