Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trim68Q8K243 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trim68Q8K243 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trim68Q8K243 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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