Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pms1Q8K119 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms