Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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