Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms