Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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