Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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