Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Brf1Q8CFK2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Brf1Q8CFK2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Brf1Q8CFK2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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