Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hpf1Q8CFE2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hpf1Q8CFE2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hpf1Q8CFE2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hpf1Q8CFE2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hpf1Q8CFE2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hpf1Q8CFE2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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