Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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