Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ccdc28aQ8CEI3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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