Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pramef8Q8CE24 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pramef8Q8CE24 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pramef8Q8CE24 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pramef8Q8CE24 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pramef8Q8CE24 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pramef8Q8CE24 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pramef8Q8CE24 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pramef8Q8CE24 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms