Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms