Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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