Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms