Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp5Q8BX09 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms