Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms