Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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