Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms