Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms