Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms