Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atg4bQ8BGE6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atg4bQ8BGE6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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