Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms