Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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ChfrQ810L3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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ChfrQ810L3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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ChfrQ810L3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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ChfrQ810L3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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ChfrQ810L3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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ChfrQ810L3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms