Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pcsk9Q80W65 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pcsk9Q80W65 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pcsk9Q80W65 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pcsk9Q80W65 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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