Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms