Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms