Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms