Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms