Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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