Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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