Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Shq1Q7TMX5 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Shq1Q7TMX5 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Shq1Q7TMX5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shq1Q7TMX5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Shq1Q7TMX5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Shq1Q7TMX5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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